يعمل قسم التسجل على غلق جميع الملفات التي لم تكتمل إجراءات تسجيلها ومضى على دفع رسومها أكثر من سنتين، حيث يكون السقف الزمني لتسجيل أو إعادة تسجيل المستحضرات الدوائية هو (6) أشهر من تاريخ دفع الرسوم.
يوفر القسم تطبيق البرنامج الإلكتروني لضمان الدقة والسرعة في إنجاز عملية التسجيل والغرض إتاحة الفرصة أمام أصحاب القرار في الوزارة والجهات الحكومية الأخرى وأصحاب الشركات والمكاتب العلمية للتعرف على المعلومات التي تخص عملية التسجيل الإلكتروني من خلال الاستفاده من تحليل البيانات التي سيوفرها النظام بالإضافة إلى توفير التقارير والإحصاء وإدارة المشتركين والمعاملات بشكل فعال